В прошлом году налоговая запросила пояснения по аналогичной причине. Благо, я как раз читал материал на сайте журнала «Упрощенка»
www.26-2.ru — там был детальный алгоритм, как отвечать и что приложить. Оказалось, что можно обойтись без суда, просто правильно оформив документы. Ответили грамотно и проверка завершилась без санкций.